SCALAPACK编译


SCALAPACK（Scalable SAPACK）是一个并行计算软件包，适用于分布式并行计算机。它是为异构计算而设计的，支持任何MPI，具有高效、可移植、可伸缩、高可靠等优点，利用它的求解库可以开发出基于线性代数运算的并行应用程序。源码可以从http://netlib.org/scalapack下载。



下载源码包：wget http://www.netl...

Intel-MKL


Intel数学核心函数库（MKL）是一套高度优化、线程安全的数学例程、函数，面向高性能的工程、科学核财务应用。英特尔MKL的集群版本包括ScaLAPACK与分布式内存快速傅里叶转换，并提供了线性代数（BLAS、LAPACK和Sparse Solver）、快速傅里叶转换、矢量数学与随机号码生成器等功能。



MKL的主要功能如下：


BLAS和LAPACK


S...

FFTW编译安装


FFTW是一个快速计算离散傅里叶变换的标准C语言程序集，它包含对共享和分布式存储系统的并行变换，它可自动适应你的机器、缓存、存储器大小、寄存器个数。通常比目前其他开源Fourier变换程序都要快。



编译前的准备工作


需要并行计算，设置为可以使用MPI，首先在环境变量中指定MPI


vi .bashrc


添加以下语句：


#OPENMPI3.1


e...

BLAS（BasicLinearAlgebraSubprograms，基础线性代数程序集）是一个应用程序接口（API）标准，用以规范发布基础线性代数操作的数值库（如矢量或矩阵乘法）。Netlib用Fortran实现了BLAS的这些API接口，得到的库也叫做BLAS。

BLACS


BLACS（Basic Linear Algebra Communication Subprograms）是基本线性代数通信子程序，目的是创建一个面向线性代数的消息传递接口，该接口可以在多种分布式存储平台上高效、统一地实现。源码可以从http:www.netlib.org/blacs下载



下载源码包：wget http://www.netlib.org/blacs/m...

HPC系统及相关应用领域中的一些广泛使用的库应用领域HPC系统中广泛使用的库线性代数BLAS，Lapack，ScaLack，GNU Scientific Library，SuperLU，SLEPc，ELPA，Hypre偏微分方程PETSc，Trilinos图算法Boost Graph Library，Parallel Boost Graph Library输入/输出HDF5，Netcdf，S...