Amber测试

Amber

是生物分子模拟软件之一。以Intel Composer的AVX2和AVX的CPU优化有效地做了建筑的基准。测量了在Amber官方网站被散发的408,000原子的Cellulose NVE的输入用pmemd计算了的时候的经过时间。在MPI中使用了Open MPI。

408,000原子 Cellulose NVE

特点：4CPU全核能性能顺利提高

与32并行时相比，64并行时的经过时间缩短了1.5倍，实现了顺利的性能提高。现有的8核基准也比较容易显出Amber并列性能可缩放性，在E5-4600 v3 4路服务器中也能看到。