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生物医疗健康软件
软件
分类
软件名称
版本
免费开源/商业
软件功能特点
生物医学
Chaste
3.3
免费开源
组织
生物医学
OpenCMISS
0.3
免费开源
组织、器官
生物化学
COPASI
4.15
免费开源
生物化学
细胞生物学
CellSys
5.0
免费开源
细胞
生物信息学
shapeit
v2.r790
免费开源
序列比对
分子生物学
cp2k
2.6.0
免费开源
分子结构
生物信息学
impute
2.3.2
免费开源
序列比对
分子生物学
Gromacs
4.5.3, 4.6.3, 5.0.1, 5.0.4, 5. 0.4-MIC
免费开源
模拟粒子体系的牛顿运动 方程
分子生物学
Lammps
14-Feb14, 1Aug13, 25Sep14, 9Oct14, 9Oct14-MIC
免费开源
分子动力学和自由能模拟
分子生物学
Tinker
7.1.2
免费开源
生物分子动力学计算
分子生物学
Modeller
9.14
免费开源
蛋白质结构预测
生物信息学
BWA
0.5.10-MIC, 0.7.10
免费开源
序列比对
分子生物学
Nwchem
6.5.0
免费开源
分子动力学和自由能模拟
分子生物学
NAMD
2.9, 2.10-CVS, 2.10-MIC
免费开源
生物分子动力学模拟
生物信息学
BLAST
2.2.30
免费开源
相似性序列比较和分析
生物信息学
Blat
36
免费开源
序列比对
生物信息学
Bowtie
2.2.6
免费开源
序列比对
生物信息学
BWA
0.7.12
免费开源
序列比对
生物信息学
GMAP
20160404
免费开源
序列比对
生物信息学
STAR
2.5.1
免费开源
序列比对
生物信息学
hisat2
2.0.5
免费开源
序列比对
生物信息学
Tophat
2.0.14
免费开源
序列比对
生物信息学
Velvet
1.2.10
免费开源
序列组装
生物信息学
CNVnator
0.3.2
免费开源
CNV检测和分析
生物信息学
CNVnator
0.3.2
免费开源
CNV检测和分析
生物信息学
Cufflinks
2.21.1
免费开源
转录组分析
生物信息学
GATK
3.7
免费开源
变异检测和分析
生物信息学
SnpEff
4.3
免费开源
变异注释
生物信息学
VarScan
2.3.7
免费开源
变异检测和分析
生物信息学
XHMM
20150320
免费开源
变异检测
生物信息学
BEAGLE
2.1
免费开源
基因型检测和填补
生物信息学
HMMER
3.1b2
免费开源
相似序列检索
生物信息学
IMPUTE2
2.3.2
免费开源
基因型填补
生物信息学
PLINK
1.9
免费开源
全基因组关联分析
生物信息学
Samtools
1.3.1
免费开源
NGS数据处理
生物信息学
Picard
1.129
免费开源
NGS数据处理
生物信息学
FastQC
0.11.5
免费开源
NGS数据质量控制
生物信息学
Sambamba
0.6.6
免费开源
NGS数据处理
生物信息学
Cutadapt
1.12
免费开源
NGS数据筛选
数据处理和统计分析
Rstudio
1.0
免费开源
基于网页的R语言集成开 发环境
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