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PBS任务脚本包括两部分 shell说明语句：用来说明用户使用的是哪种shell pbs提示语句：pbs指示语句是用户用来请求任务运行时所需的资源或设置任务的一些属性的。以#PBS开头 例如作业脚本： #!/bin/bash #PBS -N he #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -l walltime=1500:00:00 #PBS -j oe ... 1. 静态库管理 静态库是Linux系统中常用的一种库文件，它包含了编译后的代码，可以在程序编译时被链接到目标程序中。静态库的管理主要包括版本控制和清理无用文件两个方面。 a. 版本控制版本控制是静态库管理中非常重要的一环。为了保证程序的稳定性和可维护性，我们需要对静态库的版本进行严格控制。在Linux系统中，可以使用`libtool`这个工具来进行静态库的版本控制。`libtool`可以自... 五、Linux库文件的优化与调试1. 优化静态库静态库是程序运行时不需要动态链接的库文件，它会被编译器直接编译到可执行文件中。优化静态库可以提高程序的运行效率和减少内存占用。a. 代码优化代码优化是提高程序性能的重要手段。对于静态库来说，代码优化主要包括以下几个方面：1) 循环优化：循环是程序中常见的结构，优化循环可以显著提高程序的运行效率。循环优化的方法包括循环展开、循环合并、循环 unr... 1. 配置依赖库a. 编写配置脚本在Linux系统中，配置依赖库通常需要编写配置脚本，该脚本会根据你的系统环境和需求来设置库文件的编译选项、安装路径等。配置脚本通常使用自动化工具如`configure`脚本来完成。这个脚本会询问一些问题，或者让你选择一些编译选项，然后生成相应的编译命令。例如，当你想要编译一个依赖库如`MySQL`时，你首先需要从其官方网站下载源代码，然后运行`configu... 1. 静态库a. 编译时链接静态库（Static library）是在程序编译时被链接到目标程序中的一部分。在程序执行时，静态库的代码会被复制到执行文件中，因此，程序运行时不需要再次加载静态库，这也就意味着，静态库中的代码只会被编译一次，并在程序执行时占用固定的内存空间。在Linux 系统中，静态库通常以 `.a` 结尾。在编译程序时，编译器会自动找到静态库并进行链接。例如，如果你有一个名为... 二、Linux库文件的类型 1. 静态库（.a文件） a. 特点 静态库是Linux系统中一种常见的库文件类型，其文件扩展名为.a。静态库在程序编译时被直接嵌入到最终的可执行文件中，因此在程序运行时不需要再次加载静态库，可以节省系统资源。静态库中的函数代码只在编译时被复制到可执行文件中，不会占用运行时的内存空间，因此不会影响程序的运行效率。此外，静态库的版本更新需要重新编译程序... 1. 介绍Linux库文件的概念 Linux库文件是Linux系统中的一种特殊文件，它们包含了可以在多个程序之间共享的代码和数据。库文件通常用于实现特定的功能，如数学运算、输入输出操作、网络通信等。在Linux系统中，库文件可以分为两种类型：静态库（.a文件）和动态库（.so文件）。 静态库是在程序编译时被嵌入到可执行文件中的库文件，它们在程序运行时不需要再次加载，因此... 项目背景： 光催化技术作为一种高效、环保的绿色技术，在环境治理、能源转换和有机合成等领域具有广泛的应用前景。光催化领域的研究方法主要包括实验研究和理论计算。实验研究主要通过光谱分析、电化学测试、反应动力学等手段，探究光催化反应的机理和动力学过程。理论计算主要采用密度泛函理论（DFT）等方法，对光催化反应的微观过程进行模拟和预测。暨南大学化学与与材料学院某题组、五邑大学某课题组和澳... 项目背景： 高性能技术计算科学已逐渐成为人类科学研究的一大支柱。随着计算机技术的迅猛发展，强大的计算工具和物质基础为 HPC 的应用提供了可能，使人们可以借助计算科学来深化、优化、实验理论科学和扩展科学的研究，甚至在计算机系统上实现过去无法想象或根本无法触及的理论研究、应用开发和科学实验。在许多 HPC 应用领域，人们越来越期望借助计算机技术的新成果，通过更大规模... SCALAPACK编译 SCALAPACK（Scalable SAPACK）是一个并行计算软件包，适用于分布式并行计算机。它是为异构计算而设计的，支持任何MPI，具有高效、可移植、可伸缩、高可靠等优点，利用它的求解库可以开发出基于线性代数运算的并行应用程序。源码可以从http://netlib.org/scalapack下载。 下载源码包：wget http://www.netl... Intel-MKL Intel数学核心函数库（MKL）是一套高度优化、线程安全的数学例程、函数，面向高性能的工程、科学核财务应用。英特尔MKL的集群版本包括ScaLAPACK与分布式内存快速傅里叶转换，并提供了线性代数（BLAS、LAPACK和Sparse Solver）、快速傅里叶转换、矢量数学与随机号码生成器等功能。 MKL的主要功能如下： BLAS和LAPACK S... BLAS（BasicLinearAlgebraSubprograms，基础线性代数程序集）是一个应用程序接口（API）标准，用以规范发布基础线性代数操作的数值库（如矢量或矩阵乘法）。Netlib用Fortran实现了BLAS的这些API接口，得到的库也叫做BLAS。 OpenMPI 4.0的编译安装安装步骤：下载源码包并解压wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.0/openmpi-4.0.0.tar.bz2tar -xvf openmpi-4.0.0.tar.bz2根据OpenMPI 4.0的configur帮助说明，集群支持UCX，需要编译UCX编译安装UCXwget https:... OpenMPI3.1的编译安装用GCC编译OpenMPI，C、C++、Fortran77和Fortran90的编译器分别为mpicc，mpicxx，mpif70和mpif90OpenMPI编译器语言类型MPI编译器CmpiccC++mpicxxFortran77mpif77Fortran90mpif90安装步骤：下载源码包并解压wget https://download.open-mpi.o... OpenMPI 4.0环境下多节点并行计算测试脚本测试脚本vi test.pbs#!/bin/bash#PBS -N test#PBS -l nodes=3:ppn=28#PBS -l walltime=1500:00:00#PBS -j oe#PBS -q batchnodecpu=’cat /proc/cpuinfo|grep processor|wc -l’id=’echo $PBS_... 常用的作业控制命令qsub：提交作业qdel：取消作业qsig：给作业发送信号qhold：挂起作业qrls：释放挂起的作业qrerun：重新运行作业qmove：将作业移动到另一个队列qalter：更改作业资源属性例如：提交作业qsub test.pbs取消作业（用qstat命令获取作业号）qdel 1122停止作业qsig -s KILL 1122当某些作业由于节点死机无法删除时，可root... 编译安装MPI并行环境是提高服务器计算速度和处理能力的一种有效手段，目前，大量并行程序采用的都是基于消息传递的并行编译方式。最流行的是MPI（Message Process Interface），即标准消息传递界面，是一种基于消息传递的并行编程接口，而不是一门具体的语言。MPI有多种实现版本，如MPICH，HPMPI、OPENMPI和IntelMPI。通常用C或者Fortran语言来调用这些... 常用的PBS环境变量环境变量说明PBS_ENVIRONMENT批处理作业为PBS_BATCH，交互式作业为PBS_INTERACTIVEPBS_JOBIDPBS系统给作业分配的标识号PBS_JOBNAME用户指定的作业名称PBS_NODEFILE包含作业所用计算节点的主机名PBS_QUEUE作业所执行的队列名称PBS_O_HOME执行qsub命令的HOME环境变量值PBS_O_PATH执行q... |
